Difference between revisions of "BdbB"

From SubtiWiki
Jump to: navigation, search
Line 1: Line 1:
* '''Description:''' thiol-disulfide oxidoreductase <br/><br/>
+
1804 http://ikzzjfrq.posterous.com/123568218 ������� ��������� ����� ���� �� ������� http://znabfhade.posterous.com/123570785 ������� ������� ���� �� ������� ���� http://kxnmhbnmi.posterous.com/123502159 ������� ��������� ����� ���������� �� ������� http://dfgfaoyo.posterous.com/java-53326 ������� java ���� �������� ��� ��������� ��������� http://zpjkyzpy.posterous.com/bluetooth ������� ���� �� �������  �� bluetooth http://tycjbax.posterous.com/123462449 ������� ������������ ���� �� ������� http://irtakd.posterous.com/nokia-n90 ������� ���� �� nokia n90 http://bzasfgdo.posterous.com/nokia-l-amour ������� ���������� ���� ��� nokia ����� l amour http://odwhhocpgq.posterous.com/nokia-x3-00 ������� ���� �������� �� nokia x3-00 http://hdwbefdurm.posterous.com/6300-48013 ������� ���������� ���� �� ������� ��� ����� 6300 http://vwkbccgtxv.posterous.com/123572092 ������� ��������� ��� ���������� �������� http://sfihait.posterous.com/motorola-razrv-v3i ������� ��������� ��� �������� motorola razrv v3i http://eaxiykmh.posterous.com/stalker-nokia-n73 ������� ���� s.t.a.l.k.e.r. ��� nokia n73 http://zrpgdg.posterous.com/123582133 ������� ���������� ���� �� ������� �� ����� http://bgdqzesg.posterous.com/123556498 ������� ��������� ������ ���������� ���������� �� ��� http://scdadvh.posterous.com/176208 ������ ���� �� ������� �������  176�208 http://npcnbyguo.posterous.com/3d ������� 3d ���� �� ������� ������� ���� ������� http://tnxwaavmy.posterous.com/nokia-5610 ������� ��� ������ ���� ��� nokia 5610 http://zxjtoyoxmw.posterous.com/nokia-3250-63370 ������� ���������� ���� ��� �������� nokia 3250 ��� ����������� http://dbowux.posterous.com/nokia-7210 ������� ���������� ���� ��� nokia 7210 http://qerhqeaz.posterous.com/123499196 ������� ��������� ��� ���������� �������� ��� ������ ����� � ��������� http://imykkksxf.posterous.com/123510157 ������� ���� �������� �� ��������� ������� http://vqnfpjxia.posterous.com/123626408 ������� ���� ����� ��� ��� ���������� �������� http://mksaqqqavw.posterous.com/sony-ericsson-s500 ������� ���������� ���� �� ������� sony ericsson s500 http://kqrqetuf.posterous.com/samsung-e790 ������� ���� �� ������� samsung-e790  http://enczfc.posterous.com/java-5800-5530-5230 ������� java ����  ��� �������� ����� 5800 5530 5230 http://propcon1972.posterous.com/nokia-n81-n-gage ���� �� nokia n81 n-gage ������� �� ��������� http://bwvgek.posterous.com/70 ���� � ������� ��� �������� ����� �70 ������� http://gkpjoe.posterous.com/java ������� ������ java ���� ��� ������� � ��������� ��������� http://mpvwaz.posterous.com/nokia-5300-28958 ������� ��������� ��� ���������� ��� nokia 5300 http://vjftciywsx.posterous.com/123470156 ������� ����-���� ���������� ���� �� ������� http://synrggwkhp.posterous.com/123586452 ������� ��������� �� ��������� ��� ��������� ��������� http://tnxwaavmy.posterous.com/nokia-n73-jar ������� ��� ����������� ���� ��� nokia n73 jar ������� http://yhzwmxt.posterous.com/gt-s5230 ������� ���� �� ������� gt s5230 http://ubmtwavm.posterous.com/800 ������� ���� ��� ��������� ������� � 800 http://nukzdcwe.posterous.com/3-54078 ������� ���� �� ������� ����� �� ��������� 3 http://acurupomace.posterous.com/123476853 ������� ��������� ��� ������ ��������� �� ���������� �������� http://pjiedtjx.posterous.com/nokia-3110c ������� ���������� ���� �� nokia 3110c http://dxccvgtvk.posterous.com/nokia-s40 �������  ���������� ���� ��� nokia s40 http://zypngywp.posterous.com/lava ������� lava ���� ��������� �� ������� http://jgtnaiax.posterous.com/nokia-3120-classic ������� ���� ��� nokia 3120 classic � ��� ����������� http://bmcsgrp.posterous.com/123520893 ������� ��������� �������� ����� �� �������� http://bmcsgrp.posterous.com/nokia-64643 nokia ���� ������� http://enczfc.posterous.com/samsung-f-110 ������� ���� ��� �������� samsung f 110 http://bymkxqhu.posterous.com/nokia-6233 ������� ����������� �������� ������� � �������� nokia 6233 http://gefhxgsrz.posterous.com/nokia-5530 ������� ����������� ���� ��� nokia 5530 http://xxgwjiprb.posterous.com/-nokia-6230 ������� ����, ����, ������� ��� nokia 6230 http://uaiyvngprj.posterous.com/samsung-d900 ������� ���������� ���� ���� ��� �������� samsung d900 http://ktuvqz.posterous.com/sony-ericsson ������� ��������� ���� ��� �� �������� sony ericsson
 
 
{| align="right" border="1" cellpadding="2"
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Gene name'''
 
|''bdbB''
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Synonyms''' || ''yolK ''
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Essential''' || no
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Product''' || thiol-disulfide oxidoreductase
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Function''' || trans-acting protein folding catalyst, protein secretion
 
|-
 
|colspan="2" style="background:#FAF8CC;" align="center"| '''Metabolic function and regulation of this protein in [[SubtiPathways|''Subti''Pathways]]: <br/>[http://subtiwiki.uni-goettingen.de/wiki/index.php/Protein_secretion Protein secretion]'''
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''MW, pI''' || 16 kDa, 9.415 
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Gene length, protein length''' || 444 bp, 148 aa
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Immediate neighbours''' || ''[[bhlB]]'', ''[[sunS]]''
 
|-
 
|colspan="2" style="background:#FAF8CC;" align="center"|'''Get the DNA and protein [http://srs.ebi.ac.uk/srsbin/cgi-bin/wgetz?-e+&#91;EMBLCDS:CAB14062&#93;+-newId sequences] <br/> (Barbe ''et al.'', 2009)'''
 
|-
 
|colspan="2" | '''Genetic context''' <br/> [[Image:bdbB_context.gif]]
 
  <div align="right"> <small>This image was kindly provided by [http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/ SubtiList]</small></div>
 
|-
 
|}
 
 
 
__TOC__
 
 
 
<br/><br/>
 
 
 
= [[Categories]] containing this gene/protein =
 
{{SubtiWiki category|[[chaperones/ protein folding]]}},
 
{{SubtiWiki category|[[SP-beta prophage]]}},
 
{{SubtiWiki category|[[membrane proteins]]}}
 
 
 
= This gene is a member of the following [[regulons]] =
 
{{SubtiWiki regulon|[[Abh regulon]]}},
 
{{SubtiWiki regulon|[[AbrB regulon]]}},
 
{{SubtiWiki regulon|[[Rok regulon]]}},
 
{{SubtiWiki regulon|[[YvrHb regulon]]}}
 
 
 
=The gene=
 
 
 
=== Basic information ===
 
 
 
* '''Locus tag:''' BSU21440
 
 
 
===Phenotypes of a mutant ===
 
 
 
=== Database entries ===
 
 
 
* '''DBTBS entry:''' [http://dbtbs.hgc.jp/COG/prom/sunT-bdbA-yolJ-bdbB.html]
 
 
 
* '''SubtiList entry:''' [http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/genome.cgi?gene_detail+BG13587]
 
 
 
=== Additional information===
 
 
 
 
 
 
 
 
 
=The protein=
 
 
 
=== Basic information/ Evolution ===
 
 
 
* '''Catalyzed reaction/ biological activity:'''
 
 
 
* '''Protein family:''' NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase family (according to Swiss-Prot)
 
 
 
* '''Paralogous protein(s):'''
 
 
 
=== Extended information on the protein ===
 
 
 
* '''Kinetic information:'''
 
 
 
* '''Domains:'''
 
 
 
* '''Modification:'''
 
 
 
* '''Cofactor(s):'''
 
 
 
* '''Effectors of protein activity:'''
 
 
 
* '''[[SubtInteract|Interactions]]:'''
 
 
 
* '''[[Localization]]:''' cell membrane (according to Swiss-Prot)
 
 
 
=== Database entries ===
 
 
 
* '''Structure:'''
 
 
 
* '''UniProt:''' [http://www.uniprot.org/uniprot/P68571 P68571]
 
 
 
* '''KEGG entry:''' [http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?bsu:BSU21440]
 
 
 
* '''E.C. number:'''
 
 
 
=== Additional information===
 
 
 
=Expression and regulation=
 
 
 
** '''Operon:''' ''[[sunT]]-[[bdbA]]-[[sunS]]-[[bdbB]]'' [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/16306698 PubMed]
 
 
 
* '''Expression browser:''' [http://genome.jouy.inra.fr/cgi-bin/seb/viewdetail.py?id=bdbB_2265225_2265671_-1 bdbB] {{PubMed|22383849}}
 
 
 
* '''Sigma factor:'''
 
 
 
* '''Regulation:'''
 
** repressed by [[Rok]] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/15743949 PubMed]
 
 
 
* '''Regulatory mechanism:'''
 
** activated by [[YvrHb]] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/16306698 PubMed]
 
** [[Rok]]: transcription repression [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/15743949 PubMed]
 
** [[AbrB]]: transcription repression{{PubMed|20817675}}
 
** [[Abh]]: transcription activation {{PubMed|20817675}}
 
 
 
* '''Additional information:'''
 
 
 
=Biological materials =
 
 
 
* '''Mutant:'''
 
 
 
* '''Expression vector:'''
 
       
 
* '''lacZ fusion:'''
 
 
 
* '''GFP fusion:'''
 
 
 
* '''two-hybrid system:'''
 
 
 
* '''Antibody:'''
 
 
 
=Labs working on this gene/protein=
 
 
 
=Your additional remarks=
 
 
 
=References=
 
'''Additional publications:''' {{PubMed|20817675}}
 
<pubmed>11872755 15743949, </pubmed>
 
 
 
[[Category:Protein-coding genes]]
 

Revision as of 18:27, 18 April 2012

1804 http://ikzzjfrq.posterous.com/123568218 ������� ��������� ����� ���� �� ������� http://znabfhade.posterous.com/123570785 ������� ������� ���� �� ������� ���� http://kxnmhbnmi.posterous.com/123502159 ������� ��������� ����� ���������� �� ������� http://dfgfaoyo.posterous.com/java-53326 ������� java ���� �������� ��� ��������� ��������� http://zpjkyzpy.posterous.com/bluetooth ������� ���� �� ������� �� bluetooth http://tycjbax.posterous.com/123462449 ������� ������������ ���� �� ������� http://irtakd.posterous.com/nokia-n90 ������� ���� �� nokia n90 http://bzasfgdo.posterous.com/nokia-l-amour ������� ���������� ���� ��� nokia ����� l amour http://odwhhocpgq.posterous.com/nokia-x3-00 ������� ���� �������� �� nokia x3-00 http://hdwbefdurm.posterous.com/6300-48013 ������� ���������� ���� �� ������� ��� ����� 6300 http://vwkbccgtxv.posterous.com/123572092 ������� ��������� ��� ���������� �������� http://sfihait.posterous.com/motorola-razrv-v3i ������� ��������� ��� �������� motorola razrv v3i http://eaxiykmh.posterous.com/stalker-nokia-n73 ������� ���� s.t.a.l.k.e.r. ��� nokia n73 http://zrpgdg.posterous.com/123582133 ������� ���������� ���� �� ������� �� ����� http://bgdqzesg.posterous.com/123556498 ������� ��������� ������ ���������� ���������� �� ��� http://scdadvh.posterous.com/176208 ������ ���� �� ������� ������� 176�208 http://npcnbyguo.posterous.com/3d ������� 3d ���� �� ������� ������� ���� ������� http://tnxwaavmy.posterous.com/nokia-5610 ������� ��� ������ ���� ��� nokia 5610 http://zxjtoyoxmw.posterous.com/nokia-3250-63370 ������� ���������� ���� ��� �������� nokia 3250 ��� ����������� http://dbowux.posterous.com/nokia-7210 ������� ���������� ���� ��� nokia 7210 http://qerhqeaz.posterous.com/123499196 ������� ��������� ��� ���������� �������� ��� ������ ����� � ��������� http://imykkksxf.posterous.com/123510157 ������� ���� �������� �� ��������� ������� http://vqnfpjxia.posterous.com/123626408 ������� ���� ����� ��� ��� ���������� �������� http://mksaqqqavw.posterous.com/sony-ericsson-s500 ������� ���������� ���� �� ������� sony ericsson s500 http://kqrqetuf.posterous.com/samsung-e790 ������� ���� �� ������� samsung-e790 http://enczfc.posterous.com/java-5800-5530-5230 ������� java ���� ��� �������� ����� 5800 5530 5230 http://propcon1972.posterous.com/nokia-n81-n-gage ���� �� nokia n81 n-gage ������� �� ��������� http://bwvgek.posterous.com/70 ���� � ������� ��� �������� ����� �70 ������� http://gkpjoe.posterous.com/java ������� ������ java ���� ��� ������� � ��������� ��������� http://mpvwaz.posterous.com/nokia-5300-28958 ������� ��������� ��� ���������� ��� nokia 5300 http://vjftciywsx.posterous.com/123470156 ������� ����-���� ���������� ���� �� ������� http://synrggwkhp.posterous.com/123586452 ������� ��������� �� ��������� ��� ��������� ��������� http://tnxwaavmy.posterous.com/nokia-n73-jar ������� ��� ����������� ���� ��� nokia n73 jar ������� http://yhzwmxt.posterous.com/gt-s5230 ������� ���� �� ������� gt s5230 http://ubmtwavm.posterous.com/800 ������� ���� ��� ��������� ������� � 800 http://nukzdcwe.posterous.com/3-54078 ������� ���� �� ������� ����� �� ��������� 3 http://acurupomace.posterous.com/123476853 ������� ��������� ��� ������ ��������� �� ���������� �������� http://pjiedtjx.posterous.com/nokia-3110c ������� ���������� ���� �� nokia 3110c http://dxccvgtvk.posterous.com/nokia-s40 ������� ���������� ���� ��� nokia s40 http://zypngywp.posterous.com/lava ������� lava ���� ��������� �� ������� http://jgtnaiax.posterous.com/nokia-3120-classic ������� ���� ��� nokia 3120 classic � ��� ����������� http://bmcsgrp.posterous.com/123520893 ������� ��������� �������� ����� �� �������� http://bmcsgrp.posterous.com/nokia-64643 nokia ���� ������� http://enczfc.posterous.com/samsung-f-110 ������� ���� ��� �������� samsung f 110 http://bymkxqhu.posterous.com/nokia-6233 ������� ����������� �������� ������� � �������� nokia 6233 http://gefhxgsrz.posterous.com/nokia-5530 ������� ����������� ���� ��� nokia 5530 http://xxgwjiprb.posterous.com/-nokia-6230 ������� ����, ����, ������� ��� nokia 6230 http://uaiyvngprj.posterous.com/samsung-d900 ������� ���������� ���� ���� ��� �������� samsung d900 http://ktuvqz.posterous.com/sony-ericsson ������� ��������� ���� ��� �� �������� sony ericsson